MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140070008 complete genome

Total Repeats: 10004

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_019965	CCG	2	6	2775875	2775880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6002	NC_019965	GT	3	6	2775914	2775919	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_019965	CAG	2	6	2776935	2776940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_019965	CAA	2	6	2776957	2776962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_019965	CAT	2	6	2776990	2776995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_019965	GCCC	2	8	2777010	2777017	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6007	NC_019965	GAC	2	6	2780648	2780653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_019965	GGT	2	6	2780687	2780692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_019965	GGC	2	6	2781214	2781219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_019965	AT	3	6	2781241	2781246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_019965	TGA	3	9	2781311	2781319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_019965	TGTT	2	8	2783057	2783064	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_019965	GTT	2	6	2783066	2783071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_019965	GAC	2	6	2783084	2783089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_019965	ACTCC	2	10	2783406	2783415	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
6016	NC_019965	ACC	2	6	2783454	2783459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6017	NC_019965	GTT	2	6	2783461	2783466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_019965	CTG	2	6	2787898	2787903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_019965	GCT	2	6	2787914	2787919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_019965	ACG	2	6	2787922	2787927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_019965	GCA	2	6	2787938	2787943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_019965	GCCCA	2	10	2787953	2787962	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6023	NC_019965	ATC	2	6	2787965	2787970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_019965	CCA	2	6	2787986	2787991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6025	NC_019965	TCG	2	6	2788038	2788043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_019965	CTT	2	6	2788052	2788057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_019965	GGT	2	6	2788063	2788068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_019965	GGT	2	6	2788083	2788088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_019965	ACG	3	9	2788200	2788208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6030	NC_019965	CGAC	2	8	2788221	2788228	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6031	NC_019965	ACC	2	6	2788254	2788259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6032	NC_019965	AGCA	2	8	2788360	2788367	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6033	NC_019965	ACC	2	6	2789321	2789326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6034	NC_019965	GCA	2	6	2789395	2789400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_019965	GGT	2	6	2789500	2789505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_019965	CCG	2	6	2792013	2792018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6037	NC_019965	GCT	2	6	2792052	2792057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_019965	GGC	2	6	2792065	2792070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_019965	GCC	2	6	2792128	2792133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6040	NC_019965	CG	4	8	2795540	2795547	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6041	NC_019965	GCG	2	6	2795553	2795558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_019965	GGGC	2	8	2795577	2795584	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6043	NC_019965	GTG	2	6	2795761	2795766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_019965	GGA	2	6	2795835	2795840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_019965	CCG	2	6	2795842	2795847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6046	NC_019965	AGC	2	6	2800233	2800238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_019965	GCCGC	2	10	2800284	2800293	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6048	NC_019965	TCA	2	6	2800370	2800375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6050	NC_019965	GCC	2	6	2800430	2800435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6051	NC_019965	CGG	2	6	2805370	2805375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_019965	GTT	2	6	2807324	2807329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_019965	GC	5	10	2807341	2807350	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6054	NC_019965	TGC	2	6	2807398	2807403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6055	NC_019965	CGGCA	2	10	2807425	2807434	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6056	NC_019965	GCT	2	6	2807461	2807466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_019965	TTG	2	6	2807540	2807545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_019965	TGC	2	6	2807554	2807559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_019965	AT	3	6	2807622	2807627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_019965	TTG	3	9	2807666	2807674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_019965	GTG	2	6	2807813	2807818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_019965	CCA	2	6	2807852	2807857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6063	NC_019965	AAT	2	6	2807884	2807889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_019965	CAC	2	6	2807937	2807942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6065	NC_019965	CAG	2	6	2807982	2807987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6067	NC_019965	CGC	2	6	2811926	2811931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6068	NC_019965	CATTT	2	10	2811964	2811973	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6069	NC_019965	AT	3	6	2811999	2812004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_019965	CGA	2	6	2812053	2812058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6073	NC_019965	TGAA	2	8	2814773	2814780	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_019965	CG	3	6	2814863	2814868	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6079	NC_019965	GCCAC	2	10	2817650	2817659	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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6082	NC_019965	GGCT	2	8	2818976	2818983	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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6092	NC_019965	GGAT	2	8	2828310	2828317	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_019965	TGCC	2	8	2830363	2830370	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6094	NC_019965	CACC	2	8	2830715	2830722	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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6098	NC_019965	ACG	2	6	2837424	2837429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6099	NC_019965	GCG	2	6	2837464	2837469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6100	NC_019965	CAT	2	6	2837479	2837484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6106	NC_019965	TGAA	2	8	2839916	2839923	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_019965	AATT	2	8	2839944	2839951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_019965	TTC	2	6	2840057	2840062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6111	NC_019965	CG	3	6	2846291	2846296	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6112	NC_019965	CCG	2	6	2846328	2846333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6113	NC_019965	CCT	2	6	2846340	2846345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6118	NC_019965	CGAC	2	8	2846461	2846468	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6119	NC_019965	GT	3	6	2847847	2847852	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_019965	CA	3	6	2847860	2847865	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6121	NC_019965	AAT	2	6	2847872	2847877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_019965	CG	3	6	2847898	2847903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6123	NC_019965	TGG	2	6	2848057	2848062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6127	NC_019965	GC	4	8	2848984	2848991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6128	NC_019965	TGT	2	6	2848992	2848997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6130	NC_019965	C	6	6	2849051	2849056	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6131	NC_019965	CGC	2	6	2851195	2851200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6163	NC_019965	ACTC	2	8	2881983	2881990	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6262	NC_019965	GTGCC	2	10	2923003	2923012	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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6432	NC_019965	TCG	2	6	3021841	3021846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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